白癜风白斑一般出现在皮肤表层和深入二层皮中的色素细胞（黑色素细胞）缺乏或减少引起，这是由于黑色素细胞的免疫反应，导致黑色素细胞逐渐死亡或失去生物活性而引起的。而且，在白癜风发病过程中，白斑和正常皮肤边缘之间存在光学显微镜下观察有黑色素细胞残留，但这些黑色素细胞呈现轻度至中度的萎缩，形态杂乱不一。因此，白癜风白斑并非仅仅位于二层皮中，而在部分病人甚至可有白斑侵犯到真皮层以下的组织，从而导致更严重的皮肤色素变化。通过对白癜风病理解剖和实验室检测的研究，可以发现白斑的病理变化范围是多种因素综合作用的结果，包括但不限于色素细胞缺乏、黑色素细胞亚群分布异常、基底膜上皮或真皮层细胞发生严重炎症反应、自身抗体异常导致炎症反应、神经系统和内分泌系统等因素。因此，对于白癜风白斑定位的精确判断和治疗，需要全面多角度地考虑。
